Joel Castro Pereira dołączył do Manchesteru United w 2012 roku po udanym okresie testowym z ekipą rezerw.
Młody bramkarz posiada zarówno szwajcarskie, jak i portugalskie obywatelstwo, a jedną z jego pierwszych drużyn było Neuchetal Xamax. Bardzo pokorny i skromny zawodnik, który przyznał, że nie mógł uwierzyć w to, że wspólne posiłki jedli z nim piłkarze pierwszego zespołu oraz sam sir Alex Ferguson.
Joel jest reprezentantem Portugalii do lat 17, który w sezonie 2012/2013 zaliczył dwa występy w barwach Akademii Manchesteru United. Wówczas jego priorytetem było przyzwyczajenie się do życia na Wyspach Brytyjskich oraz załatwienie wszelkich formalności.
Pereira bronił dostępu do bramki Czerwonych Diabłów podczas wygranego finału Milk Cup 2013 i swoją postawą zasłużył na pochwały Erica Steele’a. Rozgrywki 2013/2014 przyniosły dalsze postępy w karierze ambitnego golkipera. Występy w UEFA Youth League dodatkowo podbudowały jego reputację, czego dowodem było powierzenie mu funkcji kapitana zespołu do lat 18 przez Paula McGuinnessa.
Występ w rezerwach Czerwonych Diabłów przypieczętował niesamowitą interwencją po strzale Jacka Clougha z Boltonu. United przegrali ten mecz po rzutach karnych, lecz Joel Pereira mógł zaliczyć ten dzień do bardzo udanych. Młody bramkarz miał również okazję grać na Old Trafford podczas zremisowanego 2:2 starcia z Norwich City. Tym samym Pereira powoli ugruntował swoją pozycję w drużynie do lat 21.
Przed rozpoczęciem sezonu 2014/2015 to właśnie on był faworytem do miejsca między słupkami rezerw Manchesteru United.
- Joel bardzo dobrze rozwinął się w trakcie ubiegłego sezonu. To chłopak, którzy szybko się uczy, a jego angielski stoi obecnie na wysokim poziomie. On ciągle chce się doskonalić, lubi rywalizację i konkursy rzutów karnych. Przez swój charakter Joel nie znosi przegrywać i właśnie to może pozwolić mu na osiągnięcie bardzo wysokiego poziomu – powiedział trener młodych bramkarzy Manchesteru United, Alan Fettis.
W sezonie 2014/2015 urodzony w Szwajcarii Portugalczyk rozegrał tylko siedem spotkań ligowych w barwach rezerw Manchesteru United. W tym czasie wpuścił siedem goli i dwa razy zachował czyste konto.
17 października 2015 roku Pereira udał się na miesięczne wypożyczenie do Rochdale rywalizującego w League One. Początkowo oglądał poczynania kolegów z perspektywy ławki rezerwowych, a jego debiut przypadł na bezbramkowo zremisowane wyjazdowe starcie z Bury. Łącznie bramkarz zaliczył siedem występów w barwach The Dale.
25 lutego 2016 roku Pereira znalazł się w kadrze Manchesteru United na spotkanie z FC Midtjylland w Lidze Europy. W sierpniu tego samego roku golkiper przeniósł się do ojczyzny, gdzie zbierał doświadczenie w barwach Belenenses. W barwach nowego zespołu rozegrał dziesięć spotkań, zachowując cztery czyste konta.
Następnie powrócił na Old Trafford, gdzie 29 stycznia 2017 roku zaliczył debiut w spotkaniu przeciwko Wigan w czwartej rundzie Pucharu Anglii. 21 maja znalazł się w podstawowym składzie na mecz z Crystal Palace, w którym zachował czyste konto.
